La Bibliothèque Joanine est l'une des plus magnifiques bibliothèques baroques au monde, construite par le roi João V au XVIIIe siècle. Elle abrite plus de 300 000 livres rares datant du XVIe siècle. L'intérieur éblouit par ses sculptures dorées, ses plafonds peints et ses étagères en bois ouvragées. La bibliothèque est célèbre pour sa colonie de chauves-souris qui protègent les livres des insectes la nuit. Inscrite au patrimoine mondial de l'UNESCO avec l'Université de Coimbra, elle représente l'apogée de l'architecture portugaise. Les billets doivent être réservés à l'avance car le nombre de visiteurs est strictement limité.