Das Kloster Santa Clara-a-Nova wurde im 17. Jahrhundert auf einem höheren Hügel erbaut, um das überschwemmte alte Kloster zu ersetzen. Die Kirche beherbergt den unverwesten Leib der Heiligen Königin Elisabeth, Schutzpatronin Coimbras, in einem prachtvollen silbernen Barockschrein. Der manieristische Entwurf des Klosters stammt von Pater João Turriano und besitzt den größten Kreuzgang Portugals. Der Hauptaltar ist ein prächtiges Beispiel für vergoldetes Holz im portugiesischen Nationalstil. Das Rosenwunder der Heiligen Elisabeth wird im gesamten Kloster erzählt.