मुहम्मद अमीन खान मदरसा मध्य एशिया का सबसे बड़ा मदरसा है, जो 1851-1852 में एक विशाल आंगन के चारों ओर 125 छात्र कक्षों के साथ बनाया गया था। यह अधूरी कल्ता मीनार के बगल में है, जो खान की मृत्यु से पहले 70 मीटर तक पहुँचने की योजना थी। आज मदरसा 'ओरिएंट स्टार' होटल के रूप में संचालित होता है जहाँ मेहमान मूल छात्र कक्षों में सो सकते हैं। अलंकृत पोर्टल और नीली टाइलें खीवा के सबसे फोटोजेनिक दृश्यों में से हैं।