हड्डियों का चैपल एवोरा का सबसे डरावना आकर्षण है, जिसकी दीवारें और स्तंभ 5,000 से अधिक भिक्षुओं की हड्डियों और खोपड़ियों से सजाए गए हैं। 16वीं शताब्दी में फ्रांसिस्कन भिक्षुओं द्वारा जीवन की क्षणभंगुरता पर ध्यान के रूप में बनाया गया, यह प्रवेश द्वार पर एक डरावने शिलालेख के साथ आगंतुकों का स्वागत करता है: हम यहां हड्डियां हैं, आपकी हड्डियों का इंतजार कर रहे हैं। चैपल में दो ममीकृत शरीर भी हैं। टिकट में पवित्र कला संग्रहालय, जन्म संग्रह और पैनोरमिक छत शामिल है।