Le Musée Municipal de Faro est le deuxième plus ancien musée de l'Algarve, ouvert en 1894 pour le 500e anniversaire de la naissance du Prince Henri le Navigateur. Installé dans le magnifique couvent de Nossa Senhora da Assunção du XVIe siècle, il contient une remarquable collection d'artefacts romains, d'art religieux et de peintures. Le trésor principal est la Mosaïque d'Oceanus des IIe-IIIe siècles, découverte près de la gare actuelle et exceptionnellement bien conservée. Le paisible cloître du couvent offre une agréable échappée de la ville.