El Museo Municipal de Faro es el segundo museo más antiguo del Algarve, inaugurado en 1894 en el 500 aniversario del nacimiento del Príncipe Enrique el Navegante. Ubicado en el hermoso convento de Nossa Senhora da Assunção del siglo XVI, contiene una notable colección de artefactos romanos, arte religioso y pinturas. El tesoro principal es el Mosaico de Océano de los siglos II-III, descubierto cerca de la actual estación de tren y excepcionalmente bien conservado. El tranquilo claustro del convento ofrece un agradable escape de la ciudad.