Die Knochenkapelle ist Évoras unheimlichste Attraktion - ihre Wände und Säulen sind mit Knochen und Schädeln von über 5.000 Mönchen geschmückt. Im 16. Jahrhundert von Franziskanermönchen als Meditation über die Vergänglichkeit des Lebens erbaut, begrüßt sie Besucher mit einer erschreckenden Inschrift: Wir Knochen hier warten auf eure. Die Kapelle enthält auch zwei aufgehängte mumifizierte Körper. Der Besuch umfasst das Sakralkunstmuseum, die Krippensammlung und eine Panoramaterrasse.